More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0889 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  100 
 
 
319 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  48.1 
 
 
342 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  43.73 
 
 
352 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  40.85 
 
 
321 aa  205  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  42.01 
 
 
315 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  38.26 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  36.19 
 
 
320 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  45.28 
 
 
361 aa  198  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  46.5 
 
 
312 aa  198  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  45.08 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  44.52 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  40.38 
 
 
314 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  46.6 
 
 
313 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  41.08 
 
 
311 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  42.12 
 
 
313 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  37.46 
 
 
315 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  39.55 
 
 
314 aa  186  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  39.55 
 
 
314 aa  186  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  42.9 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  41.46 
 
 
318 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  40.68 
 
 
314 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  37.66 
 
 
313 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  42.12 
 
 
314 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  38.29 
 
 
308 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  40.68 
 
 
320 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  42.77 
 
 
315 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.55 
 
 
316 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  35.28 
 
 
315 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  35.28 
 
 
315 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  44.23 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  40.68 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  44.3 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  35.28 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  41.82 
 
 
314 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  33.12 
 
 
323 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.48 
 
 
321 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  42.95 
 
 
363 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  42.46 
 
 
330 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  41.38 
 
 
315 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  41.8 
 
 
363 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  40.58 
 
 
325 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  43.85 
 
 
329 aa  169  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  37.1 
 
 
297 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  37.1 
 
 
297 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  37.86 
 
 
328 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  36.13 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  34.48 
 
 
316 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  35.62 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  39.37 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  40.19 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.16 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.37 
 
 
312 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  34.81 
 
 
317 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  35.46 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  34.08 
 
 
389 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  37.5 
 
 
332 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  33.86 
 
 
316 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  35.76 
 
 
327 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  35.86 
 
 
321 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  41.38 
 
 
306 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  35.86 
 
 
314 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  36.05 
 
 
323 aa  159  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  43.77 
 
 
318 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  41.4 
 
 
306 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  37.82 
 
 
335 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  39.49 
 
 
313 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  36.86 
 
 
302 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  35.11 
 
 
322 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.71 
 
 
317 aa  155  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  36.16 
 
 
321 aa  155  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  34.07 
 
 
322 aa  155  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  42.17 
 
 
313 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  32.36 
 
 
314 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  32.9 
 
 
300 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  36.94 
 
 
314 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  37.22 
 
 
332 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  32.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  30.99 
 
 
410 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.92 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  39.3 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  36.25 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  38.41 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  37.22 
 
 
336 aa  153  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.43 
 
 
298 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  34.31 
 
 
336 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  40.75 
 
 
315 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  34.73 
 
 
303 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  35.46 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  35.46 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  35.46 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  35.46 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  35.14 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  35.46 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  35.46 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  34.29 
 
 
322 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  36.86 
 
 
334 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  33.02 
 
 
321 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  32.91 
 
 
319 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  35.46 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  35.14 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>