More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3326 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  100 
 
 		 329 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  52.44 
 
 		 352 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  52.38 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  56.27 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  54.97 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  54.98 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  53.85 
 
 		 361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  49.04 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  47.47 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  53.55 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  49.2 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  52.41 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  49.05 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  50.8 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  50.16 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  51.6 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  48.1 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  47.91 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  46.56 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  47.42 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  47.27 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  47.47 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  49.2 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  50 
 
 		 313 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  51.28 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  50.32 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  43.43 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  45.34 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  47.92 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  47.32 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  46.45 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  49.04 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  39.43 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  39.55 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  35.22 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.05 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.36 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  43.85 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  35.11 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  35.11 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  30.87 
 
 		 400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  35.69 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  38.75 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  36.19 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.69 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  40.32 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.36 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  34.88 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.94 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  37.66 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  37.12 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  33.44 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  40.13 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  31.01 
 
 		 401 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  34.58 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  34.58 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  34.97 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  35.42 
 
 		 322 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.81 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  35.37 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  34.66 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.66 
 
 		 317 aa  146  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  35.09 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  33.12 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  35.82 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  33.66 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  36.1 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  37.23 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  40.63 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  34.16 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  35 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  40.44 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  32.38 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  30.53 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  38.8 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  38.49 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  33.93 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  39.64 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  35.09 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.61 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  32.39 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  32.05 
 
 		 255 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  30.48 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.83 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  34.38 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  32.62 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.5 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.92 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.06 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.7 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  29.28 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  37.89 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  35.34 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 405 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  37.73 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  34.46 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.8 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  33.01 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  30.62 
 
 		 408 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  30.27 
 
 		 434 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>