More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0700 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  100 
 
 
325 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  47.45 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  43.73 
 
 
316 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  34.95 
 
 
312 aa  231  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  34.95 
 
 
312 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.19 
 
 
352 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.04 
 
 
315 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.33 
 
 
322 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.75 
 
 
342 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  33.23 
 
 
317 aa  169  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.57 
 
 
320 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.26 
 
 
315 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.26 
 
 
315 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  30.06 
 
 
314 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  33.75 
 
 
314 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.9 
 
 
315 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.35 
 
 
315 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  29.71 
 
 
314 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.63 
 
 
321 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  32.91 
 
 
313 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  31.95 
 
 
323 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  30.72 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  27.16 
 
 
325 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.25 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.07 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  28.62 
 
 
321 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  28.48 
 
 
314 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.56 
 
 
323 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  31.25 
 
 
311 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.53 
 
 
400 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  32.3 
 
 
313 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  27.72 
 
 
314 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  28.97 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  32.8 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.53 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  29.06 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.84 
 
 
335 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  32.18 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.92 
 
 
408 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.75 
 
 
327 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.75 
 
 
327 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.75 
 
 
327 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.75 
 
 
327 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.75 
 
 
327 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.75 
 
 
327 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  29.11 
 
 
291 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.75 
 
 
327 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  30.82 
 
 
313 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  28.44 
 
 
332 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  30.12 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  30.43 
 
 
327 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  30.43 
 
 
327 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  31.99 
 
 
322 aa  136  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  27.73 
 
 
313 aa  136  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.41 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.85 
 
 
300 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  31.53 
 
 
363 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  28.03 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  27.94 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.3 
 
 
409 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  30.96 
 
 
320 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.87 
 
 
386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  29.62 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  27.07 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  28.85 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  29.52 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  30.25 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  32.49 
 
 
312 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  29.84 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  26.38 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  24.92 
 
 
318 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  27.81 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  27.86 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  28.43 
 
 
336 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.72 
 
 
418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  26.76 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30.04 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  26.67 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  28.08 
 
 
314 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  26.28 
 
 
313 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.04 
 
 
405 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  29.75 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  30.48 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.27 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  29.66 
 
 
360 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  27.16 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  28.84 
 
 
381 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  28.96 
 
 
306 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.51 
 
 
317 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  30.57 
 
 
315 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.32 
 
 
405 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  28.71 
 
 
321 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.77 
 
 
313 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  25.68 
 
 
389 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  27.19 
 
 
306 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.58 
 
 
397 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  26.43 
 
 
318 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  26.35 
 
 
417 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  26.63 
 
 
307 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  29.75 
 
 
308 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>