More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0099 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  100 
 
 
357 aa  719    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  89.51 
 
 
324 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  57.06 
 
 
323 aa  352  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  41.32 
 
 
318 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.23 
 
 
315 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.23 
 
 
315 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.32 
 
 
420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.44 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  30.91 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  33.13 
 
 
322 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.23 
 
 
401 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  27.3 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.44 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  33.66 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  33.33 
 
 
305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.07 
 
 
315 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  30.77 
 
 
318 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.01 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.34 
 
 
414 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.43 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  28.95 
 
 
302 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  28.66 
 
 
420 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.94 
 
 
389 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.06 
 
 
319 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.82 
 
 
389 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  34.38 
 
 
314 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  33.23 
 
 
393 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  31.6 
 
 
429 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  30.59 
 
 
395 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  33.86 
 
 
321 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.53 
 
 
317 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.78 
 
 
311 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  31.47 
 
 
391 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.49 
 
 
410 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.48 
 
 
347 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  33.23 
 
 
312 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.08 
 
 
410 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.08 
 
 
315 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  27.9 
 
 
372 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.25 
 
 
402 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  32.79 
 
 
306 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  27.76 
 
 
393 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  26.85 
 
 
292 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1032  glucokinase  32.68 
 
 
296 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000939538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  25.91 
 
 
298 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  30.06 
 
 
340 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.24 
 
 
300 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  25.34 
 
 
292 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  30.89 
 
 
332 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  26.17 
 
 
292 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  26.17 
 
 
292 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.04 
 
 
389 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  25.84 
 
 
292 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  25.91 
 
 
302 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.74 
 
 
399 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  25.84 
 
 
292 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.01 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  33.33 
 
 
393 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  26.17 
 
 
292 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  30.9 
 
 
315 aa  99  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  35.34 
 
 
418 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.52 
 
 
342 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  29.32 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  27.42 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.22 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  33.2 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  25.8 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  30.4 
 
 
417 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  28.3 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1302  ROK family protein  32.8 
 
 
297 aa  97.4  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  26.09 
 
 
292 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  31.61 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  28.07 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.48 
 
 
320 aa  96.7  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  43.69 
 
 
389 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  25.84 
 
 
292 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  28.76 
 
 
393 aa  95.9  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.21 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  35.19 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.34 
 
 
312 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  23.64 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  28.12 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.62 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  31.49 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.38 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25.83 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  30.36 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  30.33 
 
 
380 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  29.41 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  29.41 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.09 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1872  ROK family protein  32.46 
 
 
296 aa  94  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  26.58 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>