177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03250 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03250  transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  35.89 
 
 		 376 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  36.41 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  35.03 
 
 		 382 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  32.26 
 
 		 383 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  30.05 
 
 		 375 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  33.66 
 
 		 382 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  30.91 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  30.81 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.93 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  34.63 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.81 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  32.04 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  34.13 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  34.21 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.78 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  29.38 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  32.43 
 
 		 754 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  31.34 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.28 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.14 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  30.49 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  30 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  26.9 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.1 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  27.27 
 
 		 370 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  27.27 
 
 		 370 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.9 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  32.18 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.82 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.9 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  29.41 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  26.32 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  30.54 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.53 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  29.29 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  24.75 
 
 		 415 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  32.11 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  27.27 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  28 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.47 
 
 		 402 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  29.74 
 
 		 387 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  28.14 
 
 		 416 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.43 
 
 		 418 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  29.02 
 
 		 404 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  31.67 
 
 		 391 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  28.22 
 
 		 410 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.72 
 
 		 401 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  29.28 
 
 		 384 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  32.45 
 
 		 392 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  28.93 
 
 		 408 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.62 
 
 		 396 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.7 
 
 		 387 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  26.47 
 
 		 421 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  34.22 
 
 		 395 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.96 
 
 		 397 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.5 
 
 		 398 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  26.32 
 
 		 402 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.28 
 
 		 425 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  25.51 
 
 		 412 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  29.63 
 
 		 390 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  31.67 
 
 		 391 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.32 
 
 		 398 aa  52.4  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  20.6 
 
 		 381 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  28.06 
 
 		 413 aa  52  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  27.84 
 
 		 436 aa  52  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  27.84 
 
 		 389 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  28.95 
 
 		 395 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  23.88 
 
 		 409 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  28.44 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  29.32 
 
 		 473 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  28.08 
 
 		 434 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  41.67 
 
 		 417 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.24 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  25 
 
 		 409 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  25.24 
 
 		 404 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  23.16 
 
 		 364 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  30 
 
 		 414 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  25.64 
 
 		 399 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  27.32 
 
 		 439 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  28.5 
 
 		 398 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.43 
 
 		 410 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.32 
 
 		 399 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  26.05 
 
 		 393 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  31.07 
 
 		 374 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.89 
 
 		 417 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  34.95 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  27.41 
 
 		 385 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  24.26 
 
 		 415 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  25.86 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  22.62 
 
 		 425 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  23.74 
 
 		 435 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  22.62 
 
 		 425 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  29.08 
 
 		 389 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.55 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  22.28 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  29.29 
 
 		 420 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  23.6 
 
 		 405 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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