More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3538 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  100 
 
 
317 aa  591  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  43.41 
 
 
302 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  40.19 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  43.23 
 
 
335 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  47.49 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  41.1 
 
 
315 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  37.81 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  39.93 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  41.88 
 
 
299 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.62 
 
 
315 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  45.31 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  40.26 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  36.22 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.09 
 
 
303 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  41.91 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  40.36 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  37.37 
 
 
310 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  39.19 
 
 
326 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.06 
 
 
391 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  30.84 
 
 
321 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.16 
 
 
322 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  34.3 
 
 
313 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.12 
 
 
300 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.45 
 
 
315 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.45 
 
 
315 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  32.06 
 
 
313 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.65 
 
 
321 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.56 
 
 
302 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.92 
 
 
396 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  29.93 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  28.62 
 
 
404 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.85 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.02 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  35.11 
 
 
416 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.49 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.89 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  33.99 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.76 
 
 
311 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.97 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.86 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.11 
 
 
385 aa  93.2  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  33.95 
 
 
340 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  30.29 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.29 
 
 
410 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.22 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.5 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.15 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.42 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2160  ROK family protein  38.49 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  32.61 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.48 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  34.31 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.33 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.48 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.33 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27.08 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27.08 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27.08 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.08 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27.08 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.75 
 
 
422 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.51 
 
 
410 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  33.33 
 
 
321 aa  89.4  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.97 
 
 
319 aa  89  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  34.19 
 
 
392 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  31.13 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.85 
 
 
386 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.8 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.02 
 
 
400 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  26.35 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  29.25 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  26.6 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.08 
 
 
406 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.5 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  31.23 
 
 
321 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2139  ROK family protein  33.77 
 
 
316 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  32.17 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  33.67 
 
 
289 aa  87  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.58 
 
 
383 aa  85.9  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  30.91 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  34.16 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  34.16 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.24 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>