More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2160 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2160  ROK family protein  100 
 
 		 298 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  42.23 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  43.58 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  40.67 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  38.93 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  37.2 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  43.19 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  41.61 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  41.97 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  40.75 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  37.42 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.43 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  40.86 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  32.77 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  39.35 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.75 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.87 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  39.16 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.93 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  39.33 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  33.33 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.64 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.64 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.24 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  35.79 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  39.73 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  33.88 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  26.67 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.62 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.21 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.11 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.09 
 
 		 386 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  30.79 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.48 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  34.63 
 
 		 417 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  26.16 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  30.57 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.53 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  34.81 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  30.1 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  27.99 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  28.21 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.29 
 
 		 404 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  30.16 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  30.16 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  30.16 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  29.47 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1025  sugar kinase  34.92 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0410056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.72 
 
 		 410 aa  85.9  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  25.64 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  31.23 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  31.68 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  26.2 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  29.58 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  35.09 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  29.64 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  27.02 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  32.43 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  29.55 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  25.08 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  30.32 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  27.81 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  30.74 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  28.44 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  20.78 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  33.05 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  32.77 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.37 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  31.6 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  31.69 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  32.78 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  31 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  42.5 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  32.35 
 
 		 405 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  30.51 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  28.62 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  31.36 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  31.29 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  30.03 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2139  ROK family protein  35.83 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.46 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  30.46 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  31.72 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  31.13 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  33.45 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  31.29 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  29.3 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  28.38 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  28.38 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  29.61 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>