More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1811 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  68.77 
 
 		 254 aa  332  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  67.33 
 
 		 260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  62.7 
 
 		 255 aa  308  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  70 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  63.49 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  63.36 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  61 
 
 		 260 aa  289  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  60 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  58.94 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  56.03 
 
 		 281 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  55.42 
 
 		 265 aa  278  9e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  54.94 
 
 		 252 aa  275  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  57.37 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  57.44 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  55.2 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  57.2 
 
 		 253 aa  268  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  55.02 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.82 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  56.33 
 
 		 244 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  54.76 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.06 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  56.96 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  52.99 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  52 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  57.83 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  53.6 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  54.22 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  54.22 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  54.22 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  53.41 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  54.36 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  52.63 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  51.29 
 
 		 266 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  49.8 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  48.57 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  50.64 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  50.2 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  34.98 
 
 		 239 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  34.15 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  31.71 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  33.74 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  31.34 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.21 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  30.59 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  31.98 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.1 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  29.6 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  29.51 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.01 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.85 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.85 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  33.2 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  29.39 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.43 
 
 		 300 aa  86.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.72 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  23.49 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.71 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.48 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  30.23 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  30.92 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  29.73 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  31.85 
 
 		 304 aa  72  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  27.84 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  27.84 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  33.54 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  30.23 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  27 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  29.73 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  29.25 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  28.09 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  25.95 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  30.36 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  30.92 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  27.8 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  26.2 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  28.71 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  30.08 
 
 		 311 aa  62  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  25.82 
 
 		 299 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  28.66 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  25.97 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  23.73 
 
 		 478 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  28.71 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  26.52 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  28.9 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0651  sugar kinase  31.31 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0799966  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  25.76 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  28.39 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  32.04 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  27.03 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  24.6 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  27.62 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  27.63 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.61 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  25.84 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  26.22 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>