More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0297 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  100 
 
 
321 aa  614  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  56.6 
 
 
318 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  47.04 
 
 
322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  44.65 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  44.65 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  42.49 
 
 
315 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  41.14 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  41.69 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  43.53 
 
 
321 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  42.38 
 
 
322 aa  206  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  37.06 
 
 
312 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  39.56 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  41.82 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  38.85 
 
 
317 aa  195  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  41.19 
 
 
352 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  39.62 
 
 
318 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  39.44 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  36.94 
 
 
312 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  36.2 
 
 
347 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  34.34 
 
 
391 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  37.74 
 
 
316 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  44.57 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  37.31 
 
 
396 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  39.06 
 
 
321 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  33.65 
 
 
323 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  37.74 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  39.17 
 
 
342 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  37.93 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  37.93 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  37.89 
 
 
327 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  37.89 
 
 
327 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  37.89 
 
 
327 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  37.89 
 
 
327 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  37.89 
 
 
327 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  37.89 
 
 
327 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  37.89 
 
 
327 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  37.27 
 
 
327 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  38.92 
 
 
328 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  38.44 
 
 
327 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  40.32 
 
 
313 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  42.36 
 
 
312 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  40.25 
 
 
404 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  39.31 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  36.77 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.33 
 
 
316 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  37.85 
 
 
386 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  37.94 
 
 
332 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  37.46 
 
 
332 aa  168  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  39.88 
 
 
360 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  39.42 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  42.36 
 
 
323 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  35.51 
 
 
314 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  39.1 
 
 
334 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  37.12 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  35.42 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  34.71 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  37.62 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  33.44 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  35.85 
 
 
302 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  37.46 
 
 
314 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  34.17 
 
 
322 aa  162  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.7 
 
 
389 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  38.26 
 
 
300 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  39.49 
 
 
313 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  34.28 
 
 
317 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.16 
 
 
396 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.84 
 
 
399 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  36.36 
 
 
313 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  38.41 
 
 
408 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  31.86 
 
 
406 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  39.62 
 
 
314 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  38.87 
 
 
313 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  34.71 
 
 
323 aa  159  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  33.75 
 
 
335 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  36.48 
 
 
315 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  32.5 
 
 
300 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  35.42 
 
 
322 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  35.11 
 
 
401 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  35.22 
 
 
314 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  35.26 
 
 
418 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.8 
 
 
408 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  31.23 
 
 
406 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  32.68 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  39.24 
 
 
321 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  36.79 
 
 
302 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  36.91 
 
 
320 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  37.05 
 
 
429 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>