219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0417 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0417  transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  100 
 
 
373 aa  745    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.33 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.6 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  21.93 
 
 
399 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  30.15 
 
 
408 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.87 
 
 
399 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.72 
 
 
397 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.64 
 
 
410 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  20.37 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  21.95 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  36 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  31.15 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  20.88 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  27.86 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.8 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.46 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  25.85 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  19.76 
 
 
393 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  24.24 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  24.66 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  26.81 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  22.08 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  26.63 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  22.45 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.76 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  29.17 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.74 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  25.13 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  25 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  35 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.13 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  23.56 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  25.36 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.14 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  24.48 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3376  ROK family protein  23.76 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00191545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.26 
 
 
410 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.62 
 
 
383 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  29.67 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  25.76 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.63 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3375  ROK family protein  23.76 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3153  ROK family protein  23.76 
 
 
350 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.095994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1876  ROK family protein  24.26 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3400  ROK family protein  23.76 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.454218  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  23.37 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3078  ROK family protein  23.62 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.808099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  22.05 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3139  transcriptional regulator  24.26 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3373  ROK family protein  23.55 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  25 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.78 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  27.17 
 
 
404 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  38 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3047  ROK family protein  23.76 
 
 
350 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.229024  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  23.2 
 
 
406 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  21.28 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  34.04 
 
 
396 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1663  ROK family protein  25.71 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  26.44 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  22.28 
 
 
503 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  27.45 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  21 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  27.22 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.51 
 
 
400 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  20 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  23.08 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  21.47 
 
 
394 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  21.69 
 
 
393 aa  59.7  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  20.75 
 
 
443 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  26.71 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  24.62 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  24.1 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  23.49 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  24.64 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  20.37 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  39.44 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2924  ROK family protein  27.56 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.381987 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.8 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  22.22 
 
 
417 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  17.33 
 
 
400 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2545  ROK family protein  30.93 
 
 
341 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000020299  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  20.98 
 
 
396 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  36.26 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  22.84 
 
 
408 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  22.84 
 
 
408 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  22.84 
 
 
408 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  23.81 
 
 
407 aa  56.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  20.26 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0570  ROK family protein  24.68 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.68 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  22.93 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>