More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2545 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2545  ROK family protein  100 
 
 
341 aa  670    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000020299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3453  ROK family protein  42.35 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3078  ROK family protein  24.37 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.808099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1876  ROK family protein  24.86 
 
 
342 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3373  ROK family protein  24.86 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3400  ROK family protein  25 
 
 
350 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.454218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3375  ROK family protein  25 
 
 
342 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3153  ROK family protein  25 
 
 
350 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.095994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3139  transcriptional regulator  25 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3376  ROK family protein  24.7 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00191545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.08 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3047  ROK family protein  25.22 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.229024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  20.4 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.42 
 
 
395 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  23.87 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0570  ROK family protein  26.75 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.21 
 
 
408 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  23.85 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  21.92 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0549  ROK family protein  28.38 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.324047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  21.99 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  28.32 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1663  ROK family protein  27.05 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  21.68 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  23.61 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.03 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  23.2 
 
 
428 aa  72.8  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  19.83 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  20.28 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  21.01 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  21.86 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  20.86 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  19.17 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.4 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  21.86 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  22.92 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  20.79 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.28 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  22.11 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  21.16 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  21.97 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  21.99 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.31 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  27.35 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  20.08 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  23.64 
 
 
417 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  19.91 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  18.03 
 
 
391 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  19.41 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  22.54 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  23.27 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  18.15 
 
 
443 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  18.52 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  17.88 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  20.34 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.17 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1684  ROK family protein  19.83 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805279  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  21.24 
 
 
410 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  22.57 
 
 
383 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  21.51 
 
 
399 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.56 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  19.92 
 
 
398 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  22.92 
 
 
410 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  29.91 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  26.89 
 
 
297 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  18.57 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  20.4 
 
 
393 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  19.67 
 
 
420 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  22.47 
 
 
396 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  19.43 
 
 
406 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.54 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  24.79 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  18.75 
 
 
421 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.86 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.3 
 
 
311 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  18.93 
 
 
393 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  23.32 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  19.5 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  17.63 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  24.12 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  24.58 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  20.24 
 
 
754 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  18.22 
 
 
503 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  18.31 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  18.25 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  28 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  19.74 
 
 
417 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  21.01 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  21.43 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.12 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  19.56 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  18.33 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  27.14 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  19.92 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  30.36 
 
 
289 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.14 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.14 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.14 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  18.12 
 
 
429 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.14 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
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