More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3453 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3453  ROK family protein  100 
 
 		 339 aa  665    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2545  ROK family protein  42.35 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000020299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  25.97 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  23.46 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  22.65 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1876  ROK family protein  23.79 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3373  ROK family protein  24.6 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.95 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  24.11 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1663  ROK family protein  25.56 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  25.86 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  22.86 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.48 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  22.78 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3078  ROK family protein  25.24 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.808099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3376  ROK family protein  23.58 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00191545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3153  ROK family protein  23.58 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.095994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3400  ROK family protein  23.58 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.454218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3375  ROK family protein  23.58 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3047  ROK family protein  24.27 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.229024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.59 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0549  ROK family protein  31.91 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.324047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3139  transcriptional regulator  23.9 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2517  xylose repressor  27.63 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  27.63 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  27.63 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.62 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  23.11 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  20.58 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  21.65 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  23.29 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  22.27 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  23.27 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  22.27 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  20.26 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  21.72 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  22.69 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  22.61 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  19.03 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  19.77 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  23.21 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  23.79 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0570  ROK family protein  23.96 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  22.56 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  22.39 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  22.86 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  20.6 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  21.26 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  21.55 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  21.05 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  23.25 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.91 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  20.78 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  23.69 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  22.98 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  24.9 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  20.18 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  23.33 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  22.82 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  24.89 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  20 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  22.27 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  20.78 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  18.8 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  19.57 
 
 		 420 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  20 
 
 		 398 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  21.65 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  25.96 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  23.01 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  21.3 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  19.74 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  18.47 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  22.36 
 
 		 418 aa  65.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  22.46 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  19.22 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  20.7 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  21.22 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0118  ROK family protein  25.86 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0120  ROK family protein  25 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  20.26 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  22.51 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  20.34 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  18.91 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  22.51 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  18.57 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  23.28 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  21.12 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  20.26 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  26.03 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  25.51 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  23.53 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  18.51 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  21.47 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  19.65 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  22.08 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  21.81 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  22.88 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  23.63 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  22.17 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  20.94 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>