More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1865 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1684  ROK family protein  97.19 
 
 		 391 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  78.64 
 
 		 401 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  100 
 
 		 399 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  35.38 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.12 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28.91 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.57 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22 
 
 		 408 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.78 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.49 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  27.11 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  27.82 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  22.62 
 
 		 391 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  25.79 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.75 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  24.29 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.78 
 
 		 399 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.9 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  27.35 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.07 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.3 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  29.55 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  23.77 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  22.49 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  25.89 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  25.36 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  27.64 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  27.84 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  25.32 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.61 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  26.89 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.88 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  27.81 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  27.9 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  29.27 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  27.8 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.3 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  25.53 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.3 
 
 		 401 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  25.82 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  25.84 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.27 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  23.88 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  31.54 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  24.04 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  25.97 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.6 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.98 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  25.65 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  27.93 
 
 		 380 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  30.19 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.03 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  25 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.29 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  23.03 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  25 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  20.6 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  23.97 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  23.55 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  25.2 
 
 		 402 aa  89.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  27.83 
 
 		 402 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  23.35 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  23.86 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  23.82 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  27.08 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  26.91 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  25.64 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.05 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  22.97 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  28.57 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.13 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25.41 
 
 		 401 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  24.07 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  24.07 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  29.88 
 
 		 420 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  24.38 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  28.42 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  28.63 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  21.99 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  25.57 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.26 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  25.07 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  27.51 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  21.99 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  26.72 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  23.18 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  22.35 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  22.35 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  22.35 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  22.35 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  22.35 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  28.23 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  24.86 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
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NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  22.86 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  27.63 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  26.72 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  23.78 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  26.16 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
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NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  23.74 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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