More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1684 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1684  ROK family protein  100 
 
 		 391 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  97.19 
 
 		 399 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  78.21 
 
 		 401 aa  624  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  34.62 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.68 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28.91 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.32 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  26.05 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  26.67 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  28.04 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  21.61 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.27 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.58 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.48 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  22.42 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  27.35 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  23.58 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.81 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  25.98 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  29.16 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.44 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  22.97 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  24.87 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  27.37 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  24.47 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  27.9 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  28.88 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.31 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  29.27 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  24.47 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.34 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.45 
 
 		 398 aa  96.3  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.44 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  26.2 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  23.44 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  27.62 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.29 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  25.14 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  27.04 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  27.65 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.79 
 
 		 418 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.37 
 
 		 434 aa  93.2  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  20.6 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  26.58 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  25.95 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
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NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  25.84 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.69 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
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NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  22.97 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  25.14 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  24.23 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.59 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.53 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.18 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  26.14 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  23.24 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  22.34 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  22.34 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.18 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  29.47 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  22.41 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  23.71 
 
 		 404 aa  86.3  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  24.09 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  24.78 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.25 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  24.47 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  27.27 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  24.73 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  28.64 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  26.87 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.47 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  22.7 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  25.58 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  28.72 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.13 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  24.18 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  29.03 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  23.71 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  23.71 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  28.77 
 
 		 754 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0880  ROK  28.46 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  22.9 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  22.91 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  24.78 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
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NC_011899  Hore_16050  glucokinase  25.23 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  21.35 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  21.35 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  21.35 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  21.35 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  27.63 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  21.35 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  22.87 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  28.1 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  23.43 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.69 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  25.35 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
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NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  28.23 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA1189  ROK family protein  25.98 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  26.83 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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