More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0208 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  100 
 
 		 374 aa  761    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  33.43 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  32.6 
 
 		 383 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  37.4 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  30.64 
 
 		 390 aa  169  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  33.54 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  35.21 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.41 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.94 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.3 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28.32 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  32.72 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.81 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.16 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.22 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.07 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  27.99 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  30.45 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.35 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.7 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.39 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.36 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.11 
 
 		 503 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.47 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.49 
 
 		 409 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.74 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.94 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.91 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.46 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.91 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.3 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.53 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  26.54 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  25.63 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  25.07 
 
 		 404 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  26.23 
 
 		 406 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.18 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  32.02 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  27.64 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  33.2 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  28.12 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.31 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  23.94 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.87 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.28 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.24 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  28.1 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.56 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  31.42 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  25.96 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.04 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  31.82 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.51 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  27.3 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.97 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  27.11 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  28.89 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.96 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.54 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  28.53 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.37 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  30.8 
 
 		 380 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  29.02 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  34.73 
 
 		 402 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.65 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  28.62 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.3 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.35 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  25.97 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.32 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  26.99 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.68 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  28.29 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  26.91 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  30.34 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.1 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.47 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  26.19 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  24.87 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  27.35 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  30.86 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  26.19 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  24.65 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  26.19 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  29.66 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.41 
 
 		 425 aa  99.4  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.3 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  29.11 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  32.95 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  23.74 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  27.81 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  26.9 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  27.56 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  33.33 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  32.86 
 
 		 313 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  33.87 
 
 		 427 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.39 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  31.73 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1271  ROK family protein  29.68 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0499308  normal  0.418273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>