More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04820  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 403 aa  800    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  30.63 
 
 		 410 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  31.63 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.71 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  32.35 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  26.49 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  27.68 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  30.4 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  26.46 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.89 
 
 		 396 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.67 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.34 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  29.72 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  30.03 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  28.79 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.1 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  30.55 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.64 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  34.19 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.74 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.94 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  27.68 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  34.56 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.28 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  29.07 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30.9 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  27.64 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  29.34 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  24.44 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  27.06 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.8 
 
 		 387 aa  86.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  31.76 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.92 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.84 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.73 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  29.89 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  30.13 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  30.03 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  27.93 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  30.77 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.65 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  29.19 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  28.38 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  22.94 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.56 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  30 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  28.45 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  34.98 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.14 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.51 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  30.1 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  27.89 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  28.07 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  25.78 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.26 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.1 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.77 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  27.25 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  30.84 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  29.18 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  29.07 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  27.86 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  27.64 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  29.02 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  27.19 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  24.1 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  25.64 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  30.38 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.37 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  28.7 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  24.32 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  30.04 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4939  ROK family protein  27.19 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  28.03 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  27.88 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  27.88 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  27.88 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.22 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  25.73 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  30.73 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.48 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.25 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  33.06 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  28.09 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  22.67 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.93 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  27.6 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  33.33 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  23.54 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  26.63 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.45 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  25.88 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  23.81 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  33.16 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  29.92 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.46 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  41 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  28.51 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  26.25 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
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NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.53 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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