20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1333 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  614  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 503 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 110 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  26.23 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  38.37 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  25.98 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.82 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1147  hypothetical protein  36.67 
 
 		 109 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0114936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 		 205 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  27.16 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  22.61 
 
 		 415 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1359  ArsR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.390289 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  26.61 
 
 		 219 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>