26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1499 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1499  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 132 aa  258  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0083  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0713  regulatory protein ArsR  38.83 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000162204 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2053  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.611537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  48.89 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2910  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  50 
 
 		 254 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  52.5 
 
 		 239 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  30.53 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 258 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5388  transcriptional regulator, IclR family  42.86 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0209911 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  41.51 
 
 		 239 aa  42  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  34.19 
 
 		 198 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 147 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 115 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  47.17 
 
 		 257 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 339 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  26.44 
 
 		 107 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  26.44 
 
 		 107 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>