More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5388 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5388  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0209911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2012  IclR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.56 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  28.99 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  33.62 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 324 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  33.89 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  33.66 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.88 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  34.62 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  36.15 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  30.99 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  31.67 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  31.03 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  31.03 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  31.03 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  30.81 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  31.58 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.44 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.92 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  29.55 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  29.87 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  30.63 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  25.35 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  29.68 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.14 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.14 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.14 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 299 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 299 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 299 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.55 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>