More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1744 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 169 aa  331  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  60.9 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 180 aa  183  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 203 aa  150  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  51.28 
 
 		 168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.3 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  48.65 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  48.08 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.84 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  41.26 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  41.26 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  41.26 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 177 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.56 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 155 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 153 aa  97.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  97.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.14 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  95.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 153 aa  94  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 152 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 157 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 157 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 150 aa  90.9  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 152 aa  90.9  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  35.14 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  37.84 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>