33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2910 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2910  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2381  transcriptional regulator, MarR family  49.23 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43402  normal  0.916761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 228 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3444  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1499  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 215 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.5 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0566  hypothetical protein  34.85 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0667  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 174 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  35.09 
 
 		 109 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  27.2 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  29.49 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  29.49 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  30.88 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  30.88 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  33.33 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 116 aa  40  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 113 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>