109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0566 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  36.99 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 287 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  36.99 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 107 aa  48.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  34.21 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  33.82 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  27.03 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  31.88 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2641  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.455046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3121  ArsR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0157  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.7 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  31.58 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0698  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2001  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  34.33 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  31.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  35.82 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2910  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  34.33 
 
 		 244 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 270 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  27.12 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  30.34 
 
 		 101 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  30.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  30.34 
 
 		 101 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  30.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  30.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  30.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  30.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  30.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 322 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  30.34 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 298 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.33 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 		 300 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  33.87 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2587  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344462  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  32.81 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  29.87 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0928  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>