21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0201 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  79.76 
 
 		 88 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  66.28 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  65.88 
 
 		 88 aa  123  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  36 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 219 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  35.94 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.34 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  30.51 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1272  hypothetical protein  32.1 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.658952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>