21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1814 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  93.59 
 
 
80 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  73.24 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  50 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
86 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  50 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  42.22 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  32.88 
 
 
292 aa  45.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  37.29 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.77483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>