28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0703 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  57.89 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  61.83 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  57.48 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.96 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  35 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  51.92 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 223 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0924  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  38.57 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  35.44 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  43.4 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  45.76 
 
 		 118 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1272  hypothetical protein  37.5 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.658952 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  61.29 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  47.62 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 111 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>