31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0775 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  91.04 
 
 		 134 aa  255  1e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  60.77 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  61.83 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  38.75 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  55.81 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  52.08 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  45.28 
 
 		 292 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  33.9 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  35.79 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1272  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.658952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  38.37 
 
 		 143 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0860  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 114 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 111 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.1 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  61.29 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>