20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1248 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  79.76 
 
 		 86 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 97 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  77.03 
 
 		 88 aa  126  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  43.33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.34 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  32.81 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  36.92 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  35.19 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2088  putative regulatory protein  27.42 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.373377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>