20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0990 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0990  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 83 aa  168  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.683159  hitchhiker  0.00169297 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1814  ArsR family transcriptional regulator  73.24 
 
 		 79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346706  normal  0.834101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  66.23 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  63.51 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0805  ArsR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.126396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0905  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2028  putative regulatory protein  47.06 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1248  regulatory protein, ArsR  36.92 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0201  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.364749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  51.11 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  42 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1759  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0694565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  40.32 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0687  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0139545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0264  regulatory protein, ArsR  33.85 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297288  decreased coverage  0.00633224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0703  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.286988  normal  0.459468 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1838  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  hitchhiker  0.000363735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1280  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  32.2 
 
 		 475 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>