19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0606 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  100 
 
 
54 aa  105  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  70.37 
 
 
54 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  63.27 
 
 
55 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0613  paREP10  64.58 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  56.25 
 
 
55 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  60.53 
 
 
57 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  54.17 
 
 
52 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  47.92 
 
 
55 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  54.17 
 
 
57 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  59.46 
 
 
55 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2303  paREP10  54.17 
 
 
50 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  57.78 
 
 
57 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  60.53 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  55 
 
 
56 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  61.54 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  54.17 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  48.84 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1970  hypothetical protein  52.08 
 
 
57 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  42 
 
 
99 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.195493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>