17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0811 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  100 
 
 
55 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  69.39 
 
 
54 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  63.27 
 
 
54 aa  70.5  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0613  paREP10  65.96 
 
 
56 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  51.06 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  51.06 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  44.68 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  47.62 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  50 
 
 
57 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  44.68 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2303  paREP10  42.55 
 
 
50 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0412  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  45.95 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.778851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  50 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  43.18 
 
 
53 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  45.45 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  47.22 
 
 
56 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  48.72 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>