More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4632 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
166 aa  326  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  61.64 
 
 
151 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  59.59 
 
 
151 aa  181  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.58 
 
 
153 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  49.31 
 
 
175 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
186 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  44.16 
 
 
165 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
179 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
167 aa  114  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 
143 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 
149 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 
158 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
151 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
150 aa  97.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
136 aa  94  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 
153 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
161 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.19 
 
 
165 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
158 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.65 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.65 
 
 
153 aa  90.9  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.9 
 
 
154 aa  90.9  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.81 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  34.9 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.37 
 
 
153 aa  89  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.69 
 
 
153 aa  88.6  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.69 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.69 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.69 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
147 aa  88.2  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.23 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.72 
 
 
150 aa  87.4  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
151 aa  87  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
148 aa  87  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
156 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.69 
 
 
153 aa  87  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.69 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
152 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.29 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.08 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
176 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.41 
 
 
154 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
155 aa  84.7  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
153 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.89 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.01 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
156 aa  84  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.34 
 
 
153 aa  84  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.92 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.45 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.41 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.41 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.41 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.41 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.41 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.41 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  32.41 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.76 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>