More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4090 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 		 152 aa  300  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  96.71 
 
 		 152 aa  294  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  62.07 
 
 		 152 aa  187  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  56.64 
 
 		 167 aa  166  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  55.78 
 
 		 156 aa  166  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  54.48 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 182 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 170 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 170 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.97 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 186 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 150 aa  94  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 174 aa  91.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 174 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 174 aa  87.8  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  87.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  37.59 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.23 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  37.4 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.53 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.53 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  34.53 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>