More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2333 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
143 aa  288  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  82.52 
 
 
182 aa  238  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  81.12 
 
 
158 aa  235  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  74.83 
 
 
147 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  77.21 
 
 
136 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  71.63 
 
 
149 aa  215  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  72.46 
 
 
150 aa  214  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  71.72 
 
 
158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  68.09 
 
 
168 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  68.09 
 
 
165 aa  202  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  68.53 
 
 
151 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  64.34 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  66.19 
 
 
149 aa  192  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  67.38 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  55.4 
 
 
150 aa  166  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  58.99 
 
 
156 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  56.12 
 
 
166 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  56.12 
 
 
166 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  53.24 
 
 
159 aa  147  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 
156 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  52.14 
 
 
152 aa  147  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  55.4 
 
 
160 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  48.15 
 
 
144 aa  134  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  48.94 
 
 
153 aa  133  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  47.79 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
156 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  42.36 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
152 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  43.57 
 
 
167 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
152 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
167 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
155 aa  103  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 
174 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
179 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
153 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
170 aa  96.7  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
170 aa  96.7  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.58 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  39.17 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
170 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
155 aa  94  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
174 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
150 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
163 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
174 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
174 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
153 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 
154 aa  90.1  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2201  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
156 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 
150 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 
150 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
174 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
161 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 
174 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
186 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
155 aa  87.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
161 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 
147 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  36.64 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 
175 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>