More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4616 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  57.4 
 
 		 186 aa  201  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  55.9 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  56.74 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 174 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  49.31 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  45.62 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 143 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  46.26 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  51.06 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 150 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 151 aa  98.6  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 152 aa  98.2  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.36 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 151 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  94  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 148 aa  91.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.49 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 144 aa  87.8  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.97 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  33.54 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 152 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 		 153 aa  85.1  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.53 
 
 		 144 aa  84.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 145 aa  84  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.61 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  38.13 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.13 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>