More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2826 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  41.38 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3068  transcriptional regulator, AsnC family  39.23 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  40.14 
 
 		 156 aa  105  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 162 aa  103  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 181 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 162 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 162 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 162 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 162 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 157 aa  97.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 		 161 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.65 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 174 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  31.97 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2201  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 174 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  32.19 
 
 		 162 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 162 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 162 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 174 aa  90.5  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 161 aa  90.1  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 155 aa  90.1  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  38.17 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  38.17 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  36.11 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  34.48 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>