More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1770 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  323  5e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  39.13 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 174 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  36.36 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  34.29 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.94 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 174 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.56 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 175 aa  87.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  31.34 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  31.34 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 182 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  32.12 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 151 aa  84.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  34.29 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  30.2 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 150 aa  84  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  31.85 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  35.54 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  27.56 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  30.6 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>