More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5843 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  86.3 
 
 		 182 aa  254  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  81.12 
 
 		 143 aa  235  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  73.29 
 
 		 147 aa  218  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  71.53 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 		 136 aa  204  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  67.72 
 
 		 158 aa  203  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  68.49 
 
 		 151 aa  197  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  65.07 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  66.9 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  61.35 
 
 		 168 aa  192  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  61.88 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  64.08 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  57.04 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  53.96 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  47.86 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.96 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 167 aa  97.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 		 175 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40.29 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  40.29 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  41.01 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  39.57 
 
 		 167 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.71 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  39.57 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  38.57 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  38.57 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38.57 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  38.57 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  38.57 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  38.57 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  37.41 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>