More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1298 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  86.16 
 
 
166 aa  246  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  86.16 
 
 
166 aa  246  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  85.06 
 
 
156 aa  244  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  81.88 
 
 
159 aa  241  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  80.82 
 
 
150 aa  236  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  59.86 
 
 
151 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
182 aa  159  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  59.15 
 
 
165 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 
168 aa  157  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 
149 aa  156  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 
147 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  61.83 
 
 
136 aa  154  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  55.4 
 
 
143 aa  154  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  58.16 
 
 
152 aa  152  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.34 
 
 
158 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  53.42 
 
 
158 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  53.42 
 
 
150 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  53.52 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  53.29 
 
 
161 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  52.14 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  48.09 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
153 aa  104  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
145 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
145 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  41.94 
 
 
167 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  37.59 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
145 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  43.07 
 
 
153 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  40.69 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  37.98 
 
 
150 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  37.98 
 
 
150 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  37.67 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.06 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 
144 aa  84  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  37.04 
 
 
162 aa  84  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
167 aa  84  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.29 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  38.84 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  36 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  36 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  36 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.11 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  37.23 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 
162 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>