More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2696 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  317  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  67.38 
 
 		 143 aa  197  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  65.96 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  68.79 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  65.25 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  65.49 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  64.79 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.08 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  62.94 
 
 		 156 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  55.71 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  57.75 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  52.48 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  53.96 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  44.53 
 
 		 144 aa  121  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  48.57 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  48.94 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  44.12 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  51.06 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.26 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.18 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.96 
 
 		 144 aa  94  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 170 aa  90.9  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 151 aa  90.9  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  40.4 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.15 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 153 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  43.07 
 
 		 151 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  40.68 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  43.22 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  43.22 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  43.22 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  39.74 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 167 aa  85.1  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>