More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2941 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  71.72 
 
 		 143 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  71.14 
 
 		 182 aa  210  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  73.24 
 
 		 151 aa  204  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  67.72 
 
 		 158 aa  203  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  68.53 
 
 		 149 aa  203  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  66.23 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  65.28 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 147 aa  187  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  62.68 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  62.24 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  68.79 
 
 		 161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  58.04 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  48.92 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  45.71 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.44 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  48.28 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  47.79 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  45.62 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 179 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35.51 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  39.67 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 147 aa  90.5  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.1 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 145 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.67 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  42.75 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 145 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.04 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  36.29 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  33.55 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  37.4 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>