More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5879 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  376  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  61.96 
 
 		 165 aa  215  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  57.4 
 
 		 175 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  54.11 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 174 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  48.12 
 
 		 167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.68 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  46.31 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  44.38 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.96 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 152 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.41 
 
 		 152 aa  98.6  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 151 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 148 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 		 162 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 153 aa  95.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  95.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 152 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  38.78 
 
 		 163 aa  94.4  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  39.19 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  39.61 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  39.04 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 150 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 167 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 154 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  39.07 
 
 		 167 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 149 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  38.41 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  38.78 
 
 		 164 aa  91.3  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  38.36 
 
 		 164 aa  90.9  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.29 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 169 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 165 aa  88.2  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 146 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 157 aa  88.2  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 143 aa  87.8  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 151 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 150 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  35.57 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.57 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 147 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  38.78 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 169 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 152 aa  85.1  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 166 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 151 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.33 
 
 		 187 aa  84.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 		 161 aa  84.3  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>