More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3532 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  86.62 
 
 		 159 aa  272  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  76.71 
 
 		 148 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  68.57 
 
 		 141 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 148 aa  191  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  60.42 
 
 		 157 aa  180  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 149 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  55.94 
 
 		 149 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.61 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  44.2 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  38.81 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 151 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  40.58 
 
 		 155 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  39.42 
 
 		 152 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 153 aa  101  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  99  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 152 aa  95.5  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 151 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 158 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 164 aa  94.4  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 164 aa  94.4  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 162 aa  94.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  34.85 
 
 		 158 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 144 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 152 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  31.91 
 
 		 145 aa  91.3  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 147 aa  84.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  84.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 153 aa  84.7  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  33.57 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  29.41 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0015  HTH-type transcriptional regulator LrpB  29.84 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>