More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0144 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  297  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  76.71 
 
 
187 aa  229  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  72.97 
 
 
159 aa  219  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  71.94 
 
 
141 aa  207  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 
148 aa  192  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 
149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  61.9 
 
 
157 aa  186  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  56.34 
 
 
149 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
170 aa  123  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  46.04 
 
 
155 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  46.04 
 
 
155 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
153 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
157 aa  120  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  44.93 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 
151 aa  114  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
149 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  42.03 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 
160 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
150 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 
160 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  40.88 
 
 
152 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
165 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 
152 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
153 aa  104  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 
152 aa  103  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  41.91 
 
 
149 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
156 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  42.65 
 
 
158 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
145 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  38.06 
 
 
151 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
173 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
152 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  38.97 
 
 
164 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  38.97 
 
 
164 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
168 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
167 aa  97.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
164 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 
165 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
162 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  34.04 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
173 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
154 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  35.61 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  38.19 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
150 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.71 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
171 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
150 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
149 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
150 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
149 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
149 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
150 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
150 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
171 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  34.96 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.54 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  39.5 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  36.11 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  30.97 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>