More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3569 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 152 aa  307  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 153 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 170 aa  163  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  44.68 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  44.12 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  44.14 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  38.81 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  39.26 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  39.86 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  39.86 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  45.11 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  37.04 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 165 aa  97.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  37.12 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.24 
 
 		 187 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  37.14 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 151 aa  90.5  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 154 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 172 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  35.88 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  35.71 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  35.61 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>