More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8068 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
152 aa  169  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  55.78 
 
 
152 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  53.47 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  56.64 
 
 
167 aa  157  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  54.17 
 
 
153 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
143 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  47.26 
 
 
147 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  50.76 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.44 
 
 
165 aa  117  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  48.94 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  47.79 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 
149 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  42.41 
 
 
182 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 
158 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 
152 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  43.84 
 
 
156 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
150 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
153 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.54 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
167 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
161 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
161 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
161 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
161 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
161 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
159 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
161 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
161 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
156 aa  94  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
181 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
181 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
181 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
181 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
163 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  32.28 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  34.69 
 
 
155 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 
174 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
174 aa  87.8  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
148 aa  87.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 
149 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>