More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3176 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 168 aa  207  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  63.98 
 
 		 182 aa  205  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  66.67 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  66.23 
 
 		 158 aa  199  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  64.34 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  65.07 
 
 		 158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  63.45 
 
 		 149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  63.38 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  64.38 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  62.94 
 
 		 161 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  59.42 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  51.75 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  46.43 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  41.73 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  42.86 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 157 aa  97.1  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35.21 
 
 		 144 aa  96.3  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 145 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  42.14 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 149 aa  90.9  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  36.24 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  36.24 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.4 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  37.19 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  41.13 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  37.9 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.84 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>