More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14050 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  58.04 
 
 
149 aa  176  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  57.82 
 
 
150 aa  175  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 
149 aa  173  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 
182 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  58.99 
 
 
143 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  56.64 
 
 
147 aa  167  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  57.04 
 
 
158 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  59.42 
 
 
156 aa  164  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  58.04 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  59.09 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 
168 aa  160  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  53.85 
 
 
165 aa  160  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
150 aa  144  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  53.96 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  46.76 
 
 
144 aa  131  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 
166 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 
166 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 
156 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  45.07 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
160 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 
167 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.13 
 
 
152 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
149 aa  84.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  38.18 
 
 
152 aa  84  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  40.16 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  40.34 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.22 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.52 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  33.76 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  38.68 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  57.97 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  34.84 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  39.45 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  39.81 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.09 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  37.4 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  36 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  37.72 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  40.91 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  31.51 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  39.09 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  36.52 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  39.32 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>