More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3244 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
163 aa  328  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  79.11 
 
 
162 aa  260  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
167 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  43.8 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
240 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.5 
 
 
181 aa  97.1  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
168 aa  97.1  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
150 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
156 aa  87  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
154 aa  84.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
151 aa  82  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  38.84 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  32.65 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  39.5 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  31.43 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  32.62 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.61 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.11 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  30.71 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  29.79 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  28.66 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  28.66 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  35.82 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  28.66 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  28.66 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  27.45 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  28.66 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.67 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  26.57 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  31.91 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>