More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2326 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
137 aa  265  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  76.64 
 
 
137 aa  212  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  72.99 
 
 
137 aa  203  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  73.72 
 
 
137 aa  202  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  72.99 
 
 
137 aa  199  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.04 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  29.71 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  36.97 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.62 
 
 
153 aa  67  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.91 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
169 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  36.97 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  30.56 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.43 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  31.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.21 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  30 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.41 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0907  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.04 
 
 
199 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.71 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  31.11 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  36.79 
 
 
338 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  31.03 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  29.32 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.93 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
192 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>