More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7972 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 146 aa  286  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  57.04 
 
 		 151 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  59.29 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.22 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  57.04 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  57.04 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  52.82 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  52.74 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 163 aa  146  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  53.52 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  46.48 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  47.18 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  41.91 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  40.44 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 186 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  38.36 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 174 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  34.96 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  37.84 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  30.99 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.39 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.77 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>